蛋白質體鑑定

全系統蛋白質鑑定

串聯式質譜儀(tandem MS)普遍使用於鑑定經膠體電泳或液相層析分離後的蛋白質身份。大量的蛋白質樣品經常利用二維膠體電泳分析並將篩選後的蛋白質進行質譜儀身份鑑定。然而,這樣的方式受限於適合分析含量相對充足或是特定性質種類的蛋白質。此外,較差的再現性與較小的動態分析範圍使得二維膠體電泳分析無法有效率地提供相對複雜樣品完整的蛋白質資訊,如全細胞、組織、血漿樣品或組織液等複雜系統。以串聯式質譜儀為基礎的散彈式蛋白質體學(Shotgun Proteomics)分析方法與多維液相層析蛋白質鑑定技術(MudPIT),對於大規模的蛋白質體分析是相當有效率的。在獲得串聯式質譜圖譜數據後,蛋白質身份即可經由蛋白質資料庫的搜尋比對得到。這樣的方法是目前分析高通量的全系統蛋白質鑑定與定量最具有優勢的技術,可有效抒解與滿足生醫領域的研究需求。我們提供客製化服務方案,可分析特定複雜樣品或細胞與胞器內大量的蛋白質資訊。

分段掃描分離模式

分段掃描分離模式(GPF)技術是個有效且直接的分析策略,可得到分析樣品中更高的蛋白質體覆蓋率(proteome coverage)。同一樣品以質譜儀進行多次分析,每次只針對幾個較窄的荷值比(m/z)區間進行偵測,最後再將數據合併進行資料庫搜尋比對。此法與單次直接掃描全範圍(full scan)相比,可大幅度增加蛋白質鑑定的數量。這對於分析特定胞器或未經分離的高度複雜混和樣品之大規模蛋白質體是相當有幫助的。由於GPF不需經過繁瑣的分析處理流程,此方法是一個省時且符合經濟成本效益的蛋白質鑑定選擇。我們亦提供多種客製化樣品前處理方法,搭配GPF檢測模式,以滿足多樣的複雜生物樣品需求。

散彈式蛋白質體分析

以多维蛋白質鑑定技術(MudPIT)為基礎的散彈式蛋白質體分析法 (Shotgun Proteomics)是一種目前廣泛應用於研究大規模蛋白質體的方法,一般先將蛋白質混合物(如全細胞、組織、血液、組織液等)經過酵素水解消化成大量的胜肽片段,然後利用強陽離子交換層析(SCX)進行胜肽分離,收下來的fractions分別去鹽並進行液相層析連接串聯飾質譜儀(LC-MS/MS)分析,經過蛋白質資料庫比對後,可以得到大量的蛋白質資訊,相較於分段掃描分離模式(GPF),此法可以鑑定到更多的蛋白質,非常適合用來獲得全面性的蛋白質體資訊。多維蛋白質鑑定技術加速了蛋白質分析進程,並允許蛋白質生物標記開發更有效率。我們提供客製化套組分析方式,協助您解決分析複雜生物系統的難題。